Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD35Q8N283 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms