Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms