Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms