Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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WDR53Q7Z5U6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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WDR53Q7Z5U6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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WDR53Q7Z5U6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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WDR53Q7Z5U6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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