Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms