Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms