Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms