Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms