Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFRF1Q6IPR1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms