Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CARMIL2Q6F5E8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms