Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms