Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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