Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms