Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC184Q52MB2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms