Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VWC2Q2TAL6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms