Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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