Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms