Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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