Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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