Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ECM1Q16610 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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ECM1Q16610 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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ECM1Q16610 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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