Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms