Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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DDB1Q16531 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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DDB1Q16531 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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DDB1Q16531 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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DDB1Q16531 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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DDB1Q16531 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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DDB1Q16531 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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