Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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CNGA3Q16281 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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CNGA3Q16281 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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CNGA3Q16281 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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CNGA3Q16281 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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CNGA3Q16281 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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