Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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