Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSC22D1Q15714 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms