Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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