Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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UBE3CQ15386 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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UBE3CQ15386 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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UBE3CQ15386 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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