Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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