Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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