Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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