Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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