Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms