Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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