Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms