Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms