Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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