Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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