Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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