Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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LSAMPQ13449 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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