Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GOLGA4Q13439 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GOLGA4Q13439 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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