Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R2Q13319 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms