Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.474e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.157e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.947e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 AL390195.1-201ENST00000445680 415 ntTSL 35.05□□□□□ -1.67e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 RPS2-207ENST00000527826 837 ntTSL 1 (best)31.29■■■□□ 2.65e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 RPS2-206ENST00000527302 719 ntTSL 330.85■■■□□ 2.535e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.754e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 04e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 212.64□□□□□ -0.395e-9■■□□□ 13.6
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PABPC4Q13310 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.451e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.881e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.523e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 SUV39H1-201ENST00000337852 2978 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 CHRAC1-202ENST00000518971 925 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.841e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 RPA1-207ENST00000574049 3849 ntTSL 58.33□□□□□ -1.081e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 CHRAC1-205ENST00000523569 618 ntTSL 26.66□□□□□ -1.341e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 CHRAC1-204ENST00000519618 811 ntTSL 35.36□□□□□ -1.551e-16■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 TACC3-208ENST00000484264 551 ntTSL 218.2■□□□□ 0.56e-13■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 RPS4X-204ENST00000486733 1820 ntTSL 59.12□□□□□ -0.951e-34■■□□□ 13.5
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PABPC4Q13310 KHSRP-212ENST00000600480 851 ntTSL 219.03■□□□□ 0.645e-7■■□□□ 13.5
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PABPC4Q13310 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.174e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.174e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.663e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.023e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 FKBP8-204ENST00000596015 612 ntTSL 320.29■□□□□ 0.844e-7■■□□□ 13.5
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PABPC4Q13310 TIMM50-209ENST00000597666 604 ntTSL 325.77■■□□□ 1.723e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 TIMM50-217ENST00000601403 769 ntTSL 522.93■■□□□ 1.263e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.494e-6■■□□□ 13.5
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PABPC4Q13310 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.354e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.444e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ZC3H7A-204ENST00000570918 1410 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ZC3H7A-206ENST00000571405 1930 ntTSL 27.84□□□□□ -1.162e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.32e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.642e-7■■□□□ 13.5
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PABPC4Q13310 GOLGA2-214ENST00000611957 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 34e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.435e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.15e-7■■□□□ 13.5
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PABPC4Q13310 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 13.5
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PABPC4Q13310 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.997e-9■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -17e-9■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 DDX24-204ENST00000553451 486 ntTSL 35.58□□□□□ -1.527e-9■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 CKB-203ENST00000553610 542 ntTSL 320.84■□□□□ 0.933e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 PTOV1-209ENST00000597793 1716 ntTSL 1 (best)22.5■■□□□ 1.199e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 PTOV1-216ENST00000601093 522 ntTSL 213.85□□□□□ -0.199e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.432e-35■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 MRPS25-202ENST00000420267 590 ntTSL 415.28■□□□□ 0.042e-35■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-35■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-35■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 HSPB1-203ENST00000447574 1455 ntTSL 1 (best)23.86■■□□□ 1.414e-11■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.914e-11■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-10■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.31e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.653e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ETFA-212ENST00000560179 650 ntTSL 210.48□□□□□ -0.731e-7■■□□□ 13.5
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PABPC4Q13310 CPED1-204ENST00000428526 2219 ntTSL 28.98□□□□□ -0.972e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.232e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.372e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 CPED1-205ENST00000443817 1118 ntTSL 1 (best)5.39□□□□□ -1.552e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 EIF3G-213ENST00000593054 453 ntTSL 513.33□□□□□ -0.282e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ISOC2-206ENST00000589108 706 ntTSL 217.24■□□□□ 0.356e-10■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 STK11-202ENST00000585465 3554 ntTSL 514.8□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 ACTN4-208ENST00000497637 877 ntTSL 222.9■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.44e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 AGTRAP-208ENST00000476309 748 ntTSL 317.53■□□□□ 0.44e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.054e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.64e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 AC026464.4-201ENST00000570054 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.183e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.257e-9■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 POLD1-204ENST00000593981 873 ntTSL 524.09■■□□□ 1.451e-6■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 CCNF-201ENST00000293968 4173 ntTSL 1 (best)16.07■□□□□ 0.162e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.254e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 FBL-202ENST00000593503 628 ntTSL 37.69□□□□□ -1.189e-11■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 UNC13D-212ENST00000589670 668 ntTSL 321.57■■□□□ 1.042e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 C14orf2-206ENST00000554287 361 ntTSL 38.26□□□□□ -1.094e-8■■□□□ 13.5
PABPC4Q13310 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)25.26■■□□□ 1.632e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 523.34■■□□□ 1.332e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.122e-8■■□□□ 13.4
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