Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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