Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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