Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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