Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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