Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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STX4Q12846 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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STX4Q12846 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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