Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GTF3C1Q12789 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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