Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms