Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms